دستورالعمل ها و بخشنامه هاي گروه پيشگيري و مبارزه با بيماريها
1) بيماري هاي واگير
واكسيناسيون و ايمن سازي :
· برنامه گسترش ايمن سازي (EPI )
· عوارض ناخواسته ايمنسازي
· زنجيره سرما و توزيع واكسن ، سرم و مواد بيولوژيك
· تزريق ايمن
بيماري هاي قابل پيشگيري با واكسن
**راهنماي كشوري مبارزه با سل 
بيماري هاي قابل انتقال بين حيوان و انسان
** ليشمانيوز جلدي (سالك)
بيماري هاي منتقله از بندپايان و حشرات
بيماري هاي منتقله از آب و موادغذايي
بيماري هاي آميزشي
بيماري هاي نوپديد
**دستورالعمل مراقبت انفلوانزا در دوران پس از پاندمي
**جهانگيري آنفلوآنزاي A (H1N1)
**راهنماي آموزشي HIV/AIDS و STI (ويژه پزشكان)
بيماري هاي بازپديد
2) بيماري هاي غير واگير
· برنامه پيشگيري از سوانح و حوادث (جامعه ايمن )
· برنامه پيشگيري از بيماري هاي قلبي و عروقي
· برنامه پيشگيري از بيماري غدد و متابوليسم
· برنامه كنترل بيماري هاي سرطاني
** گزارش كشوري ثبت سرطان 1387
· نظام مراقبت عوامل خطر بيماريهاي غيرواگير
· برنامه كنترل بيماري هاي ژنتيك
** طرح کنترل فنیل کتونوری (PKU) و کاهش عوارض کمبود G6PD
3) ساير برنامهها
· مراقبت ، پيشگيري و كنترل طغيان ها و همه گيري بيماريها
· برنامه نظام مراقبت عفونت هاي بيمارستاني NNIS
· برنامه مراقبت بيماريها در زندانها
· برنامه كنترل بيماريها در جمعيت اتباع و مهاجرين خارجي
· برنامه مراقبت بيماريها در اکيپ سيار
· برنامه مراقبت فعال بيماريها